Mit 10 statt wie in den beiden Vorjahren 16 Teilnehmern und mit nur einem großen Gastwrestler (Satoshi Kojima) war der G1 Climax 2006 deutlich kleiner als die Turniere der letzten Jahren. So fehlte beispielsweise auch erstmals "Mr. G1" Masahiro Chono, der wegen einer Armverletzung erst im Laufe der Tour seine Rückkehr feiern konnte, und auch Shinsuke Nakamura war aufgrund seines US-Aufenthalts nicht im Teilnehmerfeld vertreten. Dafür waren mit Jushin Thunder Liger und Koji Kanemoto (der den Spot von Minoru übernahm, der sich dazu entschloss nicht am Turnier teilzunehmen, obwohl ihm ein Platz als Sieger des Best of the Super Jr. zugesichert wurde) gleich zwei Jr. Heavyweight Wrestler vertreten. Kanemoto war es dann letztlich auch, der für eine der größten Sensationen in der Geschichte des G1 Climax sorgte, als er am letzten Tag der Gruppenphase ein 30-minütiges Unentschieden gegen Yuji Nagata erzielte und in Folge dessen als erster Jr. Heavyweight überhaupt ins Halbfinale einzog! Im Block B, in dem beide kämpften, hatte sich Hiroyoshi Tenzan souverän mit einer perfekten Bilanz von 4-0 durchgesetzt. Im Block A war es nicht minder interessant, denn mit Hiroshi Tanahashi war der seit kurzem neue IWGP Heavyweight Champion am Start. Tanahashi gewann nur zwei Wochen vor dem G1 ein One Night Tournament um den vakanten Titel, obwohl er zuvor in großen Singles Matches meistens den Kürzeren zog. So war es auch nicht verwunderlich, dass ihm immer noch das letzte Etwas fehlte um sich gegen Superstars wie Kojima oder Giant Bernard durchzusetzen. Die einzigen beiden Siege konnte er gegen Manabu Nakanishi und Liger verbuchen, und schied somit als amtierender Champion in der Gruppenphase aus, was nicht nur ihn selbst sondern auch viele Beobachter enttäuschte. Im Fokus des Turniers standen aber spätestens ab dem Halbfinale zwei andere Wrestler: Tenzan und Kojima, die ehemaligen Tag Team Partner. Bevor Kojima 2002 zu All Japan wechselte, war TenKoji das wohl beste Tag Team im Pro-Wrestling. Die Allianz zerbrach, sodass sich beide zwangsläufig dem Singles Wrestling widmeten. Tenzan gewann seither mehrfach den IWGP Heavyweight Title und war bereits 2003 und 2004 beim G1 erfolgreich, während Kojima durch eine eineinhalbjährige Triple Crown Regentschaft zum MVP der japanischen Wrestling Szene aufstieg. Kojima beendete im Halbfinale Kanemotos unglaublichen Lauf, während Tenzan das aller erste Aufeinandertreffen zwischen ihm und Giant Bernard für sich entschied. Somit stand das TenKoji "Traumfinale" fest. Das äußerst hart umkämpfte Finalmatch dauerte fast eine halbe Stunde, bevor Tenzan zum Original (Ganso) TTD ansetzte und Kojima kopfüber auf die Bretter schickte. Tenzans dritter G1 Erfolg in vier Jahren war perfekt. Erst als zweiter Wrestler überhaupt nach Riki Choshu 1996 gelang es ihm das Turnier ohne einen einzigen Punktverlust zu gewinnen!

Block A:
1. Satoshi Kojima [7]
2. Giant Bernard [5]
3. Hiroshi Tanahashi [4]
4. Jushin Thunder Liger [2]
5. Manabu Nakanishi [2]

06.08.2006 @ Niigata City Gymnasium
- Satoshi Kojima [2] besiegt Jushin Thunder Liger [0] (14:09) mit einer Lariat.
- Hiroshi Tanahashi [2] besiegt Manabu Nakanishi [0] (14:51) mit einem Flying Sling Blade -> Jackknife Hold.

08.08.2006 @ Yokohama Bunka Gymnasium
- Giant Bernard [1] vs. Satoshi Kojima [3] - Double KO (25:54).
- Hiroshi Tanahashi [4] besiegt Jushin Thunder Liger [0] (14:18) mit einem Dragon Suplex Hold.

09.08.2006 @ Grand Cube Osaka
- Jushin Thunder Liger [2] besiegt Manabu Nakanishi [0] (8:32) mit einem Horizontal Cradle.
- Giant Bernard [3] besiegt Hiroshi Tanahashi [4] (17:54) mit dem Bernard Driver.

10.08.2006 @ Aichi Prefectural Gymnasium
- Manabu Nakanishi [2] besiegt Giant Bernard [3] (11:41) mit dem Fujiyama German Suplex Hold.
- Satoshi Kojima [5] besiegt Hiroshi Tanahashi [4] (21:55) mit einer Lariat.

12.08.2006 @ Tokyo Ryogoku Kokugikan
- Giant Bernard [5] besiegt Jushin Thunder Liger [2] (6:53) mit einem Neck-Hanging Buster.
- Satoshi Kojima [7] besiegt Manabu Nakanishi [2] (18:17) mit eine Lariat.

Block B:
1. Hiroyoshi Tenzan [8]
2. Koji Kanemoto [5]
3. Yuji Nagata [4]
4. Togi Makabe [3]
5. Naofumi Yamamoto [0]

06.08.2006 @ Niigata City Gymnasium
- Yuji Nagata [2] besiegt Naofumi Yamamoto [0] (10:28) mit einem Armlock.
- Hiroyoshi Tenzan [2] besiegt Koji Kanemoto [0] (13:07) mit dem Anaconda Vice.

08.08.2006 @ Yokohama Bunka Gymnasium
- Togi Makabe [2] besiegt Naofumi Yamamoto [0] (11:18) mit einer Lariat.
- Hiroyoshi Tenzan [4] besiegt Yuji Nagata [2] (15:41) mit einer Moonsault Press.

09.08.2006 @ Grand Cube Osaka
- Koji Kanemoto [2] besiegt Naofumi Yamamoto [0] (13:14) mit einem Ankle Hold.
- Yuji Nagata [3] vs. Togi Makabe [3] - Double Countout (15:44).

10.08.2006 @ Aichi Prefectural Gymnasium
- Hiroyoshi Tenzan [6] besiegt Naofumi Yamamoto [0] (12:28) mit dem TTD.
- Koji Kanemoto [4] besiegt Togi Makabe [3] (11:25) mit einem Falcon Arrow.

12.08.2006 @ Tokyo Ryogoku Kokugikan
- Hiroyoshi Tenzan [8] besiegt Togi Makabe [3] (12:23) mit dem Anaconda Vice.
- Yuji Nagata [4] vs. Koji Kanemoto [5] - Time Limit Draw (30:00).